Nat Biotechnol :深达解读!科学家成功清楚地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2021-11-22 02:12:07 来源:
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昨日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上新书“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的数据分析报告中的,来自欧陆分子生物学研究室等机构的发现者们通过数据分析将生命体大肠有机物第三组中的所有已知的寄生虫线粒体选集已成了一个大型的文档,从而就能鼓励数据分析技术开发人员深入即使寄生虫基因和蛋白之间的关联,以及其对生命体身体健康的影响。

寄生虫密布体液内以外,其不一定需要产生细胞内来影响本体消化系统、身体健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于体液有机物第三组已成员的数量要比体液细胞还要多,还包括寄生虫、病原体和其它有机物;为了理解寄生虫在生命体生物学中的所客串演显现出的关键性片中的,发现者们通常会在研究室中的除去并对其培养显现出来,随后在对寄生虫进行时DNAPCR,然而现阶段很多寄生虫还无法在研究室的环境中的被培养显现出来繁育。

为了得到这些寄生虫的方面信息,数据分析技术开发人员规避了另以外一种方法,他们从环境中的(比如大肠)收集一般而言检验,随后在对整个检验中的的DNA进行时PCR,然后利用计算机方法对来自一般而言检验中的的数千种特有种的有机体线粒体进行时修葺,这种方法被称之为祥线粒体学技术开发,该技术开发能作为一种替代方法对单个特有种的DNA进行时除去和PCR。

数据分析者Rob Finn说明,去年还包括我们在内的三个独立团队修葺了已成千上万个大肠有机物第三组线粒体,而最大的问题就是这些团队所得到的结果有否不具备可比性,以及有否能将这些结果选集已被选为一个非常进一步的清单。现阶段数据分析技术开发人员已经从生命体大肠中的超过4600种寄生虫群落中的选集了20万个线粒体和1.7亿个细胞内序列,这种新型的文档(独立的生命体胃大肠线粒体集合和独立的胃大肠细胞内编目)揭示了本体大肠的更大重要性,并为进一步进行时大肠有机物第三组数据分析铺平了道路。

数据分析者绘成显现出的这个更大的编目是有机物第三组数据分析的一个先行者,更进一步或将能为发现者们提供非常宝贵的教育资源来数据分析生命体大肠生态系统中的每一种寄生虫所客串演显现出的关键性片中的。这项数据分析表明,超过70%被检测到的寄生虫从而在研究室中的被已成功培养显现出来过,而其在体内的活性仅仅未知,而这类寄生虫中的最大的群体就是Comantemales;数据分析者说明,看到Comantemales如此广为真是一个精采,这就凸显了我们的确对大肠中的的寄生虫相符合,我想这个编目能鼓励生物信息学家和分子生物学家在更进一步几年补救这一知识空白。

该文档/编目收集的所有数据都能在在线教育资源Mgnify中的得到,其能鼓励发现者们分析有机物的线粒体数据并且与当前的文档进行时对比;随着世界各地数据分析团队不断发布更进一步文档,该编目可能会扩展到到还包括其它本体指甲的有机物第三组,比如皮肤或口腔内部等指甲。最后数据分析者说明,这一编目的选集更进一步或为有机物学家和临床数据分析技术开发人员提供除此以外的教育资源,然而数据分析技术开发人员可能会在西非、亚洲和西非等传奇色彩不足的地区发现更多更进一步寄生虫特有种,现阶段数据分析技术开发人员不一定清楚不一定相同一些人中的寄生虫重要性的相似之处和转变可能会。

完整显现出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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